Saskaņā ar LZA lēmumu Nr.2/1 tika nodibināts 21.05.1992. Latvijas Zinātņu akadēmijas Kodolpētniecības centrs. Reģistrēts Uzņēmumu reģistrā 1993.gada 22.janvārī ar Nr. 000311197. Saskaņā ar 2.06.1998.gada MK rīkojumu Nr.293 iestāde tiek reorganizēta un ar 1999.gada 1.janvāri izveido BO SIA "Reaktors" Vides Aizsardzības un reģionālās attīstības ministrijas pārziņā. Saskaņā ar 2003.gada 3.decembra Ministru kabineta rīkojumu Nr. 744, iestāde pārdēvēta par Radioaktīvo atkritumu pārvaldības valsts aģentūru, saīsinājumā " BAPA"
